故事的舞台是在战争中被破坏的基地殖民地、飘荡着大量战舰的残骸的“Thunderbolt宙域”，宙域是对ZEON公国要塞“A Bao A Qu”的补给道路，为了夺回宙域，地球连邦军和ZEON公国展开了激烈的战斗。地球连邦军的伊奥·弗莱明少尉等人乘坐GM204F，潜入Thunderbolt宙域，向狙击手发起了挑战。 自上映之后机动战士高达雷霆宙域第二季这部动漫凭借其引人入胜的剧情和演员的精湛演技，受到众多观众追捧，一时间成了影迷圈常提及的话题。
